Les organes d’administration et de gestion de Maroc Citrus sont :
L’Assemblée Générale constitué de 51 membres représentant toutes les composantes de la filière agrumicole : ASPAM (15), AMAPAC (2), ASCAM (15), AMITAG (2) et Citrus Exort (17).
Le Conseil d’Administration composé de 21 membres représentant également tous les maillons de la filière: ASPAM (6), AMAPAC (1), ASCAM (6), AMITAG (1) et Citrus Exort (7).
Le Bureau composé de 9 membres et chargé d’assister le Président dans ses fonctions.
Maroc Citrus est dotée d’une Direction chargée de la gestion des dossiers de cette interprofession et du suivi de la mise en œuvre de son plan d’actions arrêté par le Conseil d’Administration.